Un plan permanent de nettoyage et de désinfection est prévu de manière à assurer que toutes les sections de l'établissement et tout le matériel sont convenablement traités. Il inclut également le nettoyage et la désinfection de l'équipement de nettoyage et de désinfection.
L'application de ce plan est un préalable à toute activité de production (Programme prérequis). Il est réalisé par du personnel spécialement formé.
Ce plan global peut être complété par des opérations de nettoyage et éventuellement désinfection, liées directement à l'activité de production (lavage des couteaux en cours de préparation des produits, par exemple), généralement réalisées par le personnel de production. La fréquence et la nature de ces nettoyages/désinfection est en lien direct avec l'activité (volume, produit) de production considérée.
Afin d'empêcher la contamination des aliments, tout le matériel et les ustensiles sont nettoyés, désinfectés et rincés aussi souvent que nécessaire et en particulier à l'issue et avant chaque journée de travail. Leurs éléments démontables en contact avec les denrées, couteaux et grilles notamment, sont séparés, nettoyés, désinfectés et rincés à la fin des opérations.
Après l'arrêt du travail quotidien, ou à n'importe quel autre moment, si les circonstances l'exigent, les sols et les murs des zones de manipulation des aliments sont nettoyés à fond.
Les plans de nettoyage/désinfection spécifient notamment :
les zones, les équipements et ustensiles à nettoyer,
la nature des détergents et des désinfectants, les dosages utilisés, la durée d'application des détergents et désinfectants (compatible avec leur efficacité),
les responsabilités et les compétences pour la réalisation des différentes tâches,
les méthodes et la fréquence de nettoyage et de désinfection,
les procédures de suivi, …
Le plan de nettoyage/désinfection prend également en compte les opérations de nettoyage intermédiaire qui peuvent avoir lieu en cours de journée (par exemple, lorsqu'il y a changement de matières premières pour la préparation).
Lorsque l'établissement dispose d'installations d'approvisionnement d'eau privée (eau potable, eau de mer propre), ces installations sont régulièrement nettoyées et désinfectées en conformité avec les exigences réglementaires (sélection des produits, …). Le nettoyage et la désinfection de ces installations sont inclus dans le plan de nettoyage et désinfection. Par exemple, lorsque l'établissement stocke de l'eau de mer propre, le nettoyage et la désinfection des bassins de stockage de l'eau sont inclus dans le plan de nettoyage et désinfection.